根據(jù)機構管理辦法的規(guī)定：注冊在分支機構的專職注冊房地產(chǎn)估價師，不計入設立分支機構的房地產(chǎn)估價機構的專職注冊房地產(chǎn)估價師人數(shù)。因此，分支機構的估價師只能注冊在分公司且在分公司繳納社保。